遭遇论文侵权，应先按实际损失或侵权所得赔偿。依据《著作权法》，若损失或所得难以计算，可参照权利使用费赔偿。不及时处理可能导致权益持续受损，影响学术声誉及经济利益。
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论文侵权赔偿常见方式有协商、调解、诉讼等。建议先尝试与侵权方协商，协商不成可考虑向著作权管理部门调解或提起诉讼，根据具体情况选择最合适的处理方式。
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论文侵权需赔偿。处理方式：1.收集证据，如侵权文章、发表时间等；2.与侵权方协商，要求停止侵权并赔偿；3.协商无果，向著作权管理部门投诉或法院起诉，提交证据，请求赔偿。